すみません、ランチに行く時にチャットで
ランチに行きますとか言うんですが、ボスは、いってらっしゃいを返事してくれて、戻る時は戻りましたを言って、ボスはおかえりなさいと返事します、

この時は私はは何を返事していいでしょうか
また、行ってらしゃいとか言ったら、私は何の返事していいでしょうか？返事は必要ですか。
これはチャットでのやり取りですが。

ただいま？
それはうちに帰る時だと思いますが、
お手数おかけし、すみません、
返事する方にありがとうございます、

よろしくお願いいたします とはどういう意味ですか?

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「ランチに行きます」「いってらっしゃい」で会話が完結します。
「ランチに行ってきます」「いってらっしゃい」の方が流れは自然な気はしますが。

「ただいま」は家に帰る時だけに使う言葉ではありません。
「外」からある拠点に戻ってきた時に、
「中」にいる人に対して、戻ったことを伝える挨拶となります。

「ただいま」を省略せずに言うと
「ただいま（外から）戻りました」または
「ただいま（出先から）帰りました」となります。

そもそも「ただいま」は漢字で書くと「只今」と書き、
「今、この瞬間」といった意味でしかありません。

「ただいま戻りました」「ただいま帰りました」と毎回いうのは長いので、
前半の「ただいま」だけに略した形が、
帰宅や帰社時の挨拶になったものです。

「戻りました」「おかえりなさい」というやり取りは、

「ただいま」「おかえりなさい」
「ただいま戻りました」「おかえりなさい」
「ただいま帰りました」「おかえりなさい」

と言っているのと意味は同じです。
「おかえりなさい」で会話が完結しています。

どうしても何かしらの反応をしたいのならば、
チャットツールによりますがサムズアップの絵文字や笑顔の顔文字などで
「返事を見た」という反応するくらいが妥当な気がします。